Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mc1rQ01727 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms