Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec23aQ01405 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23aQ01405 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms