Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms