Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp1Q00915 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms