Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabpaQ00422 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms