Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx2Q00262 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx2Q00262 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms