Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nbr1P97432 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nbr1P97432 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms