Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nucb2P81117 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nucb2P81117 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nucb2P81117 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nucb2P81117 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nucb2P81117 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms