Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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