Protein–RNA interactions for Protein: P63028

Tpt1, Translationally-controlled tumor protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpt1P63028 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tpt1P63028 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms