Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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