Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lmo4P61969 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lmo4P61969 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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