Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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