Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abce1P61222 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms