Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Paxbp1P58501 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms