Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp25P57080 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms