Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TdgP56581 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TdgP56581 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms