Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf5P56477 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms