Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nub1P54729 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nub1P54729 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nub1P54729 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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