Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb3P54285 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb3P54285 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms