Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnnt2P50752 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnnt2P50752 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms