Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VdrP48281 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VdrP48281 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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VdrP48281 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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VdrP48281 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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