Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms