Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf4P43488 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms