Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtgfrP43117 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms