Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx1-2P42580 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx1-2P42580 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms