Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pbx1P41778 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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