Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TtlP38585 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TtlP38585 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms