Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddit3P35639 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms