Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnar1P33896 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms