Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms