Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxraP28700 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxraP28700 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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