Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NapbP28663 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NapbP28663 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms