Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxd10P28359 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd10P28359 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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