Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl3P27659 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl3P27659 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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