Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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