Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd8P23463 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms