Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Klra1P20937 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Klra1P20937 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Klra1P20937 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Klra1P20937 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klra1P20937 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Klra1P20937 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms