Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnnc2P20801 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnnc2P20801 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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