Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a2P20490 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ms4a2P20490 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ms4a2P20490 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a2P20490 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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