Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CtsdP18242 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtsdP18242 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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