Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpraP18052 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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