Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms