Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sptan1P16546 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sptan1P16546 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms