Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcna1P16388 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms