Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp1P11438 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp1P11438 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lamp1P11438 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms