Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxd4P10628 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms