Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PolP10400 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PolP10400 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms