Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccl2P10148 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl2P10148 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms