Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PdgfrbP05622 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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PdgfrbP05622 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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